Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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