Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL27Q9Y4X3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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