Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms