Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms