Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC52A3Q9NQ40 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms