Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPIFA1Q9NP55 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms