Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDGFDQ9GZP0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms