Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCSER1Q9C0I3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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