Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL4Q9C0H6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms