Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SALL3Q9BXA9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms