Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIOK2Q9BVS4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms