Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2AFJQ9BTM1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms