Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TINF2Q9BSI4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms