Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RHOXF2Q9BQY4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms