Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms