Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SENP8Q96LD8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms