Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms