Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRTOMTQ8WZ04 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRTOMTQ8WZ04 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms