Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNDC1Q76NI1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms