Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF7Q6Q0C0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF7Q6Q0C0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms