Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD54Q6NXT1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms