Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NANOGP8Q6NSW7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms