Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRAMEF8Q5VWM4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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