Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PERM1Q5SV97 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms