Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PHYHD1Q5SRE7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms