Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms