Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC184Q52MB2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms