Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms