Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms