Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms