Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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