Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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