Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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