Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NEDD8Q15843 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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NEDD8Q15843 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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NEDD8Q15843 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8Q15843 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8Q15843 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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