Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CDSNQ15517 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CDSNQ15517 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms