Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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