Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NECTIN1Q15223 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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