Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NCAPHQ15003 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms