Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SLC10A1Q14973 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms