Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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