Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4BQ13620 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms