Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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