Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PMS2P3Q13401 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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