Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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FOXD4Q12950 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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FOXD4Q12950 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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