Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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