Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PTPN13Q12923 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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