Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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