Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms