Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF4Q08170 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms