Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CXCL9Q07325 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms